11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1057 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1057  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  357  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00747978  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0936  hypothetical protein  80.63 
 
 
190 aa  277  7e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_925  hypothetical protein  81.87 
 
 
174 aa  271  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00989395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2214  hypothetical protein  38.03 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000223654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4314  hypothetical protein  31.25 
 
 
207 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3738  hypothetical protein  26.95 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0911  hypothetical protein  30.65 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1051  hypothetical protein  30.19 
 
 
276 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0532  hypothetical protein  28.21 
 
 
295 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.535949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4313  hypothetical protein  30.28 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1505  hypothetical protein  33.78 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233696  normal  0.576417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>