23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0915 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0915  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  554  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111337  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  79.4 
 
 
268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_786  hypothetical protein  76.87 
 
 
278 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  25.89 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  25.45 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  26.16 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  23.46 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  23.47 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  20.83 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  23.29 
 
 
276 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  23.53 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  24.42 
 
 
285 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  22.83 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  23.46 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  23.35 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  20.86 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  20.71 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  21.51 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  23.04 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  19.64 
 
 
301 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  21.46 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  22.28 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  21.51 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>