More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0067 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0067  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 394 aa  816    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1243  S-adenosylmethionine synthetase  74.55 
 
 		 391 aa  610  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0391  S-adenosylmethionine synthetase  72.68 
 
 		 435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2843  S-adenosylmethionine synthetase  73.06 
 
 		 394 aa  594  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0685357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  55.67 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  53.9 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  53.44 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  52.82 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  53.56 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  54.35 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  52.31 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  53.17 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  53.56 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  53.56 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  53.32 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  53.83 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  52.39 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  52.39 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  50.13 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  53.56 
 
 		 399 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  51.15 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  49.87 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  51.59 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  50 
 
 		 397 aa  381  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  51.42 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  49.87 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  50.27 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  49.24 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  50.51 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  50.52 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  49.23 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  49.61 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  50.13 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  51.32 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  48.72 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  48.73 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  49.49 
 
 		 402 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  49.34 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  50.26 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  48.74 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  49.08 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  48.4 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  48.66 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0287  S-adenosylmethionine synthetase  47.52 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  50.13 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  50.13 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  48.66 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  49.6 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  49.62 
 
 		 401 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  48.21 
 
 		 403 aa  362  9e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  49.87 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  48.35 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  47.46 
 
 		 417 aa  358  6e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  48.68 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  48.47 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  45.94 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  49.48 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  48.81 
 
 		 399 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  46.58 
 
 		 398 aa  355  5e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0466  S-adenosylmethionine synthetase  46.21 
 
 		 411 aa  355  5.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  47.97 
 
 		 420 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0177  S-adenosylmethionine synthetase  48.96 
 
 		 389 aa  354  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.225729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  48.82 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  48.94 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  46.94 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  49.07 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  47.21 
 
 		 421 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04001  S-adenosylmethionine synthetase  45.23 
 
 		 409 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.222949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  49.08 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  49.34 
 
 		 397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03441  S-adenosylmethionine synthetase  45.98 
 
 		 413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1687  S-adenosylmethionine synthetase  45.23 
 
 		 409 aa  352  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1869  S-adenosylmethionine synthetase  45.81 
 
 		 408 aa  352  8.999999999999999e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  49.87 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  48.02 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  47.49 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  48.56 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  48.4 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0795  S-adenosylmethionine synthetase  48.56 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.50978e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  49.11 
 
 		 393 aa  350  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  47.72 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  49.61 
 
 		 397 aa  349  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  49.34 
 
 		 398 aa  348  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  45.5 
 
 		 395 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  49.6 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  48.14 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  48.42 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2688  S-adenosylmethionine synthetase  47.12 
 
 		 388 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  47.21 
 
 		 422 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  48.09 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  47.21 
 
 		 422 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>