39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4577 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4577  hypothetical protein  100 
 
 
919 aa  1900    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4533  hypothetical protein  36.62 
 
 
1403 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0371536  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3915  hypothetical protein  30.87 
 
 
1283 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2433  hypothetical protein  30.75 
 
 
1387 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5632  hypothetical protein  42.15 
 
 
1138 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000206849 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5473  hypothetical protein  42.15 
 
 
1114 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  24.87 
 
 
1009 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  24.56 
 
 
1009 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  24.2 
 
 
967 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  25.54 
 
 
1015 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  24.53 
 
 
1227 aa  74.7  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4775  hypothetical protein  25.39 
 
 
1034 aa  73.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  23.5 
 
 
1010 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  23.3 
 
 
971 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  24.93 
 
 
962 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  23.68 
 
 
1065 aa  68.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  24.66 
 
 
1170 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5619  hypothetical protein  24.66 
 
 
1003 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2633  hypothetical protein  23.96 
 
 
999 aa  62  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.753628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1772  hypothetical protein  25.21 
 
 
1039 aa  61.2  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  32.86 
 
 
1172 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  32.86 
 
 
1172 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  55.1 
 
 
717 aa  55.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  32.35 
 
 
288 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4602  hypothetical protein  21.08 
 
 
1160 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  56.41 
 
 
1089 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4558  hypothetical protein  20.69 
 
 
1173 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  54.17 
 
 
523 aa  48.5  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
158 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  36.84 
 
 
621 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  29.45 
 
 
407 aa  47  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  48.72 
 
 
283 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  52.38 
 
 
644 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  66.67 
 
 
857 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  53.66 
 
 
730 aa  45.8  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  59.38 
 
 
303 aa  45.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  42.03 
 
 
297 aa  45.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  45.45 
 
 
222 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  55.88 
 
 
328 aa  44.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>