97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2661 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2661  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  100 
 
 
260 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380126  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2589  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  75.39 
 
 
260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4825  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  74.7 
 
 
265 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04390  soluble hydrogenase delta subunit, HoxY  70.59 
 
 
256 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4497  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  70.04 
 
 
278 aa  377  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1137  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  67.58 
 
 
262 aa  364  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.126755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0506  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  66.28 
 
 
273 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1018  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  65.88 
 
 
277 aa  358  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0184891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1859  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  68.16 
 
 
271 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3428  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  63.33 
 
 
252 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897709  normal  0.335776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3480  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  63.33 
 
 
252 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3417  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  63.33 
 
 
252 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.287071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3473  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  60.74 
 
 
249 aa  308  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2533  hypothetical protein  52.23 
 
 
261 aa  278  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1262  hypothetical protein  50.39 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.484653  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2388  hypothetical protein  51.01 
 
 
261 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1056  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50.59 
 
 
265 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.688665 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0938  [NiFe] hydrogenase, delta subunit, putative  50.59 
 
 
265 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1123  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  35.42 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1969  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.48 
 
 
251 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0244  hydrogenase/sulfur reductase, delta subunit  34.01 
 
 
247 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.217236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2248  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.41 
 
 
251 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2604  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  31.95 
 
 
266 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1928  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.83 
 
 
254 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1255  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  32 
 
 
261 aa  141  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2168  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  33.33 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2131  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  34.25 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0141674  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2498  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  34.31 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0081  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  33.9 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.242431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0883  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  32 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2096  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  31.95 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2014  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  30.42 
 
 
319 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1214  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.41 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0976  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  31.49 
 
 
288 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.313048  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1008  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  30.38 
 
 
305 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1711  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  31.06 
 
 
288 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0970  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  31.06 
 
 
288 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3679  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.79 
 
 
334 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0651  F420-non-reducing hydrogenase subunit G  26.61 
 
 
300 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.907295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0071  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.51 
 
 
300 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4315  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  25.87 
 
 
489 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4293  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  25.87 
 
 
486 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0997  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  27.2 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1652  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  26.14 
 
 
317 aa  95.9  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0098  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.93 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4307  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  25.52 
 
 
488 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.340367 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4163  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  26.22 
 
 
491 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106398  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0587  F420-non-reducing hydrogenase subunit G  25.6 
 
 
312 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000383981  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0614  hydrogenase, group 3, VhuG subunit, putative  26.28 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.773338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_552  nickel-dependent hydrogenase, group 3, small subunit  24.91 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000367769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3536  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  27.69 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2259  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.93 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1672  hydrogen dehydrogenase  28.02 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1552  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  24.23 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2477  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.16 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.48758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2792  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.57 
 
 
179 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0379698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3955  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  24.54 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3885  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.99 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2715  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  29.45 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.720565  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3856  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  25.99 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3319  F420-non-reducing hydrogenase subunit G  27.19 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1792  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  25.38 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2222  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  27.91 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3973  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  27.19 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000410627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4659  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  28.4 
 
 
181 aa  72  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2249  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.01 
 
 
193 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00641529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2418  nickel-dependent hydrogenase, small subunit, putative  25.32 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1460  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.71 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4163  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.22 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0530  hydrogen dehydrogenase  27.43 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0981  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  25.58 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2749  Hydrogen dehydrogenase  24.44 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1216  hydrogen dehydrogenase  25.15 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0473732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1112  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  24 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.668315  normal  0.471993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2726  NAD-reducing hydrogenase, delta subunit  27.12 
 
 
180 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0254891  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4256  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.29 
 
 
167 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.359496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0077  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  24.16 
 
 
180 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.919997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1367  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  28.57 
 
 
181 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3540  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  25.61 
 
 
181 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4114  hydrogen dehydrogenase  21.97 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122624  normal  0.234793 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2556  NAD-reducing hydrogenase HoxS delta subunit  24.56 
 
 
184 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155572  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1524  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  21.97 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000416432  hitchhiker  0.00403982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4046  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.9 
 
 
182 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.586699  normal  0.0266692 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0075  coenzyme F420 hydrogenase  27.54 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2719  NAD-reducing hydrogenase, delta subunit  28.12 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0647  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  26.35 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0093  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  22.73 
 
 
181 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.574923 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2101  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  20.77 
 
 
191 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.656537  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0096  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  22.73 
 
 
181 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1043  coenzyme F420 hydrogenase  28.48 
 
 
227 aa  52.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0694  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  29.14 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.244067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0194  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  25.66 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0629  coenzyme F420 hydrogenase  25.66 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.871927 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1289  coenzyme F420 hydrogenase, subunit gamma  25.66 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2726  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  26.58 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0851861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0362  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  27.11 
 
 
160 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.547425  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2229  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.79 
 
 
183 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0705013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>