More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1478 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1478  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.910171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3448  50S ribosomal protein L20  83.76 
 
 
118 aa  174  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4309  50S ribosomal protein L20  85.84 
 
 
118 aa  170  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4255  50S ribosomal protein L20  82.05 
 
 
117 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2606  50S ribosomal protein L20  84.07 
 
 
117 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3500  50S ribosomal protein L20  84.07 
 
 
117 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.193711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1277  50S ribosomal protein L20  79.65 
 
 
116 aa  154  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17881  50S ribosomal protein L20  77.48 
 
 
115 aa  153  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0873829  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  67.26 
 
 
116 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00591  50S ribosomal protein L20  77.88 
 
 
115 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0057  50S ribosomal protein L20  77.88 
 
 
115 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1882  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  148  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0641503  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0054  50S ribosomal protein L20  76.11 
 
 
115 aa  147  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  66.37 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
117 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1260  50S ribosomal protein L20  77.06 
 
 
115 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  66.37 
 
 
118 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21311  50S ribosomal protein L20  77.06 
 
 
115 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.105631  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  62.83 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  61.95 
 
 
119 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  66.37 
 
 
121 aa  143  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
119 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  64.6 
 
 
119 aa  143  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  62.93 
 
 
117 aa  142  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  62.83 
 
 
118 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  62.83 
 
 
120 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18711  50S ribosomal protein L20  67.83 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  59.48 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 
117 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
120 aa  137  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18521  50S ribosomal protein L20  67.83 
 
 
115 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  64.15 
 
 
117 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  64.15 
 
 
117 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1754  50S ribosomal protein L20  68.47 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  60.18 
 
 
117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  62.73 
 
 
117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 
121 aa  133  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18521  50S ribosomal protein L20  68.47 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.331262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
119 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
118 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
117 aa  131  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
119 aa  130  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
119 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  130  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  63.73 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  60.91 
 
 
119 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  60.91 
 
 
119 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  60.91 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  60.91 
 
 
119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1044  50S ribosomal protein L20  55.45 
 
 
116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>