37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0031 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269202  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0016  tRNA-Gly  94 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4319  tRNA-Gly  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663542  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0069  tRNA-Gly  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.299902  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  90.91 
 
 
71 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  88.89 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.382329 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  89.47 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  96.15 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  89.47 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>