More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5129 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5129  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 326 aa  624  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0228  ThiJ/PfpI domain protein  46.38 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000506965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3598  transcriptional regulator, AraC family  46.38 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167816  normal  0.0986203 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 321 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 320 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  43.05 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6286  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 320 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 347 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  30.54 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 331 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 361 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  29.63 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  23.25 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.59 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  33.96 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  33.64 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  29.39 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 348 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 314 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 356 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.5 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.5 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  25.88 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.31 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>