27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3207 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3207  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  228  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1474  hypothetical protein  48.98 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1634  hypothetical protein  34.07 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0809  hypothetical protein  35.16 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0768002  normal  0.858288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1864  integration host factor  35.87 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1661  hypothetical protein  33.68 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371749  hitchhiker  0.0000841753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3448  hypothetical protein  35.23 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1860  hypothetical protein  34.07 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.39326  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1853  hypothetical protein  34.07 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07810  hypothetical protein  36.36 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.175394  normal  0.797766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11900  hypothetical protein  37.66 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000932793  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2435  hypothetical protein  35.96 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1319  hypothetical protein  34.38 
 
 
109 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129436  normal  0.2348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2579  putative integration host factor  36.76 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33240  hypothetical protein  34.62 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3741  MihF  36.76 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2410  MihF  36.76 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2416  MihF  36.76 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.623884  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2369  MIHF  36.76 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1712  integration host factor-like protein  37.97 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2666  MihF  36.76 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3098  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2344  hypothetical protein  36.76 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11417  integration host factor mihF  36.76 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282847  normal  0.291955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3196  putative integration host factor MihF  34.62 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1061  hypothetical protein  36 
 
 
105 aa  40  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2812  hypothetical protein  33.77 
 
 
107 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>