More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2969 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2969  Ribonuclease H  100 
 
 
175 aa  354  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113773  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  54.93 
 
 
235 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  55.71 
 
 
141 aa  144  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  52.45 
 
 
150 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  52.14 
 
 
150 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  52.14 
 
 
150 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  48.63 
 
 
147 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  49.66 
 
 
153 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  51.06 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  51.75 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  50 
 
 
151 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  47.3 
 
 
223 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  49.65 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  48.95 
 
 
148 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  48.68 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  49.66 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  48.32 
 
 
155 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  50 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  49.66 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  49.65 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  51.8 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  48.97 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  48.95 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  49.29 
 
 
148 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  50 
 
 
170 aa  131  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  49.29 
 
 
148 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  49.29 
 
 
148 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  47.52 
 
 
223 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  47.33 
 
 
527 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  48.57 
 
 
148 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  49.01 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  48.32 
 
 
157 aa  130  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  47.06 
 
 
145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  47.3 
 
 
145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  46.71 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  47.95 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  50.35 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  48.28 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  48.28 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  49.29 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  50.35 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  49.29 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  49.29 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  49.29 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  46.84 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  49.29 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  49.29 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  49.29 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  48.98 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  48.59 
 
 
228 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  48.98 
 
 
143 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  48.59 
 
 
228 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  51.06 
 
 
146 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4085  Ribonuclease H  44 
 
 
153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  44.19 
 
 
175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  51.02 
 
 
152 aa  127  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  50.34 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  48.57 
 
 
148 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  48.32 
 
 
163 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  49.65 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  46.36 
 
 
157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  49.3 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  48.57 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  44.59 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  48.57 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  48.57 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  47.52 
 
 
154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  47.18 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  48.59 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  46.85 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  47.26 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  45.95 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  48.57 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  45.1 
 
 
151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  47.18 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  45.95 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  48.57 
 
 
147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  48.94 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  47.55 
 
 
149 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  50 
 
 
159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  45.45 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.52 
 
 
532 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  47.26 
 
 
154 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  45.71 
 
 
150 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  46.85 
 
 
163 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02761  ribonuclease HI  46.21 
 
 
161 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.175549  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  46.94 
 
 
151 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  45.52 
 
 
146 aa  124  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1567  ribonuclease HI  46.21 
 
 
161 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  48.57 
 
 
153 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  48.57 
 
 
147 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  48.57 
 
 
147 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  44.67 
 
 
155 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  44.67 
 
 
155 aa  124  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  44.67 
 
 
155 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  44.67 
 
 
155 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  44.67 
 
 
155 aa  124  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  44.67 
 
 
155 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  44.67 
 
 
155 aa  124  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  44.67 
 
 
155 aa  124  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>