12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2685 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2685  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 170 aa  325  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000141118  normal  0.192385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0248  cupin 2 domain-containing protein  49.61 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  24.37 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31740  predicted protein  27.56 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  27.44 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  34.71 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.77 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  23.53 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.75 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.76 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 112 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>