34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1993 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1993  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  660    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795631  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4804  hypothetical protein  75.99 
 
 
365 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0479679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  35.47 
 
 
377 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  34.19 
 
 
773 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  32.89 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  39.8 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  38.2 
 
 
843 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  24.32 
 
 
793 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  36.56 
 
 
854 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  36.78 
 
 
783 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  31.78 
 
 
859 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  44.16 
 
 
803 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  40.43 
 
 
339 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  36.63 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  40.22 
 
 
795 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  35.63 
 
 
801 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  39.53 
 
 
792 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  29.38 
 
 
795 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  32.77 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  34.57 
 
 
853 aa  49.7  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  33.77 
 
 
247 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  32.65 
 
 
355 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  31.65 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  36.67 
 
 
809 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  35.8 
 
 
442 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  32.63 
 
 
916 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  38.2 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  36.78 
 
 
862 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  27.74 
 
 
862 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  24.57 
 
 
348 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.21 
 
 
340 aa  43.5  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  36.27 
 
 
447 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  29.37 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>