More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1192 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1192  diguanylate cyclase  100 
 
 		 495 aa  965    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 683 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3486  diguanylate cyclase  35 
 
 		 449 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121522  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.76 
 
 		 793 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.97 
 
 		 736 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.779609  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.49 
 
 		 748 aa  91.3  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6707  putative diguanylate cyclase (GGDEF)  41.25 
 
 		 377 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282449  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.56 
 
 		 362 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.47 
 
 		 551 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.54 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  29.54 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  36.51 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2984  GGDEF domain-containing protein  36.96 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.301535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  29.36 
 
 		 688 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0065  GGDEF family protein  34.84 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00648256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.15 
 
 		 663 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1856  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2010  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1405  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.856707  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01755  predicted diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1872  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.320559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2510  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  32.35 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.291593  normal  0.751069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3097  GGDEF family protein  38.1 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.017484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1846  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0897436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2465  diguanylate cyclase  36.96 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0690  diguanylate cyclase  33.04 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01743  hypothetical protein  32.35 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2164  sensory box protein  36.36 
 
 		 1431 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357073  normal  0.611751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  31.33 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  31.33 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  31.74 
 
 		 836 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  33.67 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.91 
 
 		 1072 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2229  GGDEF domain protein  33.19 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  31.05 
 
 		 555 aa  84  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  40.61 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  35.95 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.64 
 
 		 715 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3286  GGDEF domain-containing protein  36.25 
 
 		 595 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.65 
 
 		 739 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  32.34 
 
 		 792 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6871  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.67 
 
 		 720 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  30.94 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0429  diguanylate cyclase  35.57 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.77 
 
 		 710 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.74 
 
 		 841 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 912 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0530  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.97 
 
 		 961 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.639569  normal  0.653911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0461  CBS/GGDEF/EAL domain-containing protein  32.68 
 
 		 594 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01454  hypothetical protein  36 
 
 		 665 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0341  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.16 
 
 		 775 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40 
 
 		 868 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  31.05 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  25.46 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  33.93 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06931  hypothetical protein  34.87 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.73 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.06 
 
 		 719 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3626  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.01 
 
 		 840 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3585  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.9 
 
 		 701 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  27.9 
 
 		 718 aa  81.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.33 
 
 		 1125 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3261  GGDEF domain-containing protein  33.13 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.012427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1557  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.82 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814898 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0996  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.42 
 
 		 829 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.68 
 
 		 727 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.545647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  25.11 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3408  GGDEF family protein  32.98 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4673  hypothetical protein  39.22 
 
 		 651 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  36.36 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0581  response regulator  34.57 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000040809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3961  diguanylate cyclase  30.36 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.75 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.42 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2290  diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 646 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  31.41 
 
 		 937 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2587  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.65 
 
 		 797 aa  80.5  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.49 
 
 		 856 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0636  diguanylate cyclase  33.56 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000932  GGDEF family protein  32.69 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2312  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.65 
 
 		 597 aa  80.1  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  33.74 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  31.02 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.43 
 
 		 643 aa  80.1  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  36.09 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4658  hypothetical protein  37.06 
 
 		 818 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1635  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.43 
 
 		 643 aa  80.1  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2629  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.89 
 
 		 607 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  30.32 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  30.32 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 638 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  30.32 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.86 
 
 		 783 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2995  diguanylate cyclase  31.46 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1918  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.04 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.23924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  32.99 
 
 		 941 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>