75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0071 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0071  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G-domain protein  100 
 
 
710 aa  1296    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.479384  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  28.29 
 
 
441 aa  84  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.11 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  27.7 
 
 
481 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.57 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.57 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  27.7 
 
 
468 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.74 
 
 
542 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  27.8 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  24.14 
 
 
389 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  30.58 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  27.92 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  29.52 
 
 
419 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  31.05 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.86 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.52 
 
 
381 aa  66.6  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.56 
 
 
592 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.56 
 
 
592 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.81 
 
 
413 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.04 
 
 
378 aa  64.3  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.04 
 
 
378 aa  64.3  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.86 
 
 
587 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.42 
 
 
582 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.99 
 
 
588 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.13 
 
 
804 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.26 
 
 
657 aa  62  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.99 
 
 
588 aa  62  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.52 
 
 
624 aa  62  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.46 
 
 
438 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.08 
 
 
644 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  27.02 
 
 
412 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.83 
 
 
484 aa  58.9  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.25 
 
 
615 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.63 
 
 
825 aa  58.9  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.96 
 
 
583 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.96 
 
 
583 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.87 
 
 
495 aa  57.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.96 
 
 
583 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.96 
 
 
577 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.68 
 
 
474 aa  57.4  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  32.56 
 
 
424 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.3 
 
 
470 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  26.53 
 
 
402 aa  55.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.18 
 
 
503 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.62 
 
 
464 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  26.16 
 
 
505 aa  55.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3039  GTP-binding signal recognition particle  24.53 
 
 
452 aa  55.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.26 
 
 
388 aa  55.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.23 
 
 
583 aa  54.7  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.25 
 
 
632 aa  54.7  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.25 
 
 
632 aa  54.7  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.96 
 
 
374 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.96 
 
 
374 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.96 
 
 
374 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.88 
 
 
784 aa  53.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.1 
 
 
467 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.09 
 
 
429 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.64 
 
 
463 aa  52  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.93 
 
 
461 aa  51.6  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.51 
 
 
429 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  25.26 
 
 
626 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  27.68 
 
 
585 aa  50.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.32 
 
 
437 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1620  GTP-binding signal recognition particle  28.4 
 
 
592 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00835044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  26.95 
 
 
477 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.92 
 
 
460 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.92 
 
 
460 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.92 
 
 
460 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.92 
 
 
460 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.95 
 
 
446 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0760  Flagellar GTP-binding protein-like protein  26.05 
 
 
412 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.390787  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.66 
 
 
458 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  30.74 
 
 
442 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.66 
 
 
458 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.84 
 
 
375 aa  44.3  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>