32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2383 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2383  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3336  hypothetical protein  29.26 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0312565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2966  hypothetical protein  31.75 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3038  hypothetical protein  36.17 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0459067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  35.64 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  35.71 
 
 		 421 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  48.98 
 
 		 452 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  47.62 
 
 		 1176 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0892  Rhodanese domain protein  27.61 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0596702  hitchhiker  0.0000457584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  34.43 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31 
 
 		 657 aa  49.3  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  51.35 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  50 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  31.91 
 
 		 481 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2654  hypothetical protein  31.4 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  37.66 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  32.84 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  32.29 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  36.59 
 
 		 549 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  47.5 
 
 		 216 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  39.58 
 
 		 763 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0452  cellulosome anchoring protein, cohesin region  29.03 
 
 		 257 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 		 948 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  35.9 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  48.65 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  44.12 
 
 		 495 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  43.75 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  47.06 
 
 		 175 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  40 
 
 		 792 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  34.62 
 
 		 591 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  24.03 
 
 		 502 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  33.96 
 
 		 143 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>