31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1577 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1577  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1060    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0640  hypothetical protein  50.98 
 
 		 506 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0636  hypothetical protein  51.3 
 
 		 497 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1776  hypothetical protein  52.1 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000652545  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0136  hypothetical protein  44.91 
 
 		 500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.619185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1873  hypothetical protein  42.26 
 
 		 515 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0540  hypothetical protein  40.58 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00218193  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02540  hypothetical protein  41.45 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003580  hypothetical protein  40.59 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4922  hypothetical protein  40.32 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4974  hypothetical protein  40.12 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.164186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4820  hypothetical protein  40.32 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4928  hypothetical protein  40.67 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3618  conserved hypothetical protein  40.47 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4888  hypothetical protein  40.12 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00183026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4981  hypothetical protein  40.12 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04222  hypothetical protein  40.47 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3676  hypothetical protein  40.47 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4978  hypothetical protein  40.47 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4615  hypothetical protein  40.47 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04256  hypothetical protein  40.47 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3943  hypothetical protein  39.3 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0268  hypothetical protein  39.92 
 
 		 517 aa  363  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1985  hypothetical protein  39.15 
 
 		 522 aa  362  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2400  hypothetical protein  39.41 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0516423  unclonable  0.0000100852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2283  hypothetical protein  38.72 
 
 		 520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.02604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2066  hypothetical protein  38.43 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2062  hypothetical protein  39.03 
 
 		 520 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000491691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0271  hypothetical protein  39.37 
 
 		 523 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000729096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2407  hypothetical protein  38.4 
 
 		 519 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.05 
 
 		 670 aa  43.9  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>