57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1316 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1316  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1792  hypothetical protein  89.77 
 
 		 92 aa  161  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.783807  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1720  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2002  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2319  protein of unknown function DUF370  80.9 
 
 		 91 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000309391  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0891  hypothetical protein  89.87 
 
 		 91 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1762  hypothetical protein  88.61 
 
 		 96 aa  146  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1699  hypothetical protein  84.52 
 
 		 90 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3895  hypothetical protein  80.23 
 
 		 91 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0839  protein of unknown function DUF370  86.42 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1328  hypothetical protein  79.76 
 
 		 89 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00142046  normal  0.379596 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1598  hypothetical protein  87.18 
 
 		 95 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1034  hypothetical protein  89.19 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09800  hypothetical protein  80 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1238  hypothetical protein  79.27 
 
 		 86 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.322027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3427  hypothetical protein  82.67 
 
 		 88 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0191  hypothetical protein  79.27 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0888187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0196  hypothetical protein  79.27 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4982  hypothetical protein  81.33 
 
 		 88 aa  130  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0704941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2835  hypothetical protein  79.73 
 
 		 83 aa  127  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1474  hypothetical protein  74.12 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0083649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4125  protein of unknown function DUF370  80 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3631  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1272  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0794457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3971  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00678821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3886  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000690373 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3920  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.497874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4010  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3695  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3613  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3723  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3915  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2524  hypothetical protein  69.62 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1947  hypothetical protein  78.67 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1057  hypothetical protein  77.33 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0100  hypothetical protein  65.75 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1678  hypothetical protein  64.38 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1027  hypothetical protein  67.53 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.925684 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1144  hypothetical protein  62.65 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0986  hypothetical protein  62.65 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00163682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3631  hypothetical protein  67.53 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.890852  normal  0.0973296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1444  protein of unknown function DUF370  59.76 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.653976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0036  hypothetical protein  53.19 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1139  hypothetical protein  58.75 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_34  hypothetical protein  53.19 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0033  hypothetical protein  53.19 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0295  hypothetical protein  56.1 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0784  protein of unknown function DUF370  60 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000463016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1405  hypothetical protein  55.7 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2085  hypothetical protein  55.56 
 
 		 86 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  decreased coverage  0.00778946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2720  hypothetical protein  58.11 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0117967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2901  hypothetical protein  54.32 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2880  hypothetical protein  49.37 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000567496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2947  protein of unknown function DUF370  60.76 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0099  hypothetical protein  57.53 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0891716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1911  hypothetical protein  47.19 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000344379  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0044  protein Dvul_2085  38.16 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0851957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>