58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1156 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1156  zinc finger, CHC2-type  100 
 
 		 687 aa  1413    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000142218  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  23.65 
 
 		 604 aa  62  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  24.11 
 
 		 679 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  31.22 
 
 		 539 aa  50.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.56 
 
 		 595 aa  50.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  40 
 
 		 598 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  26.78 
 
 		 572 aa  48.9  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  37.78 
 
 		 600 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  37.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  37.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  25 
 
 		 646 aa  48.1  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  22.01 
 
 		 576 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  28.74 
 
 		 587 aa  48.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  37.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  37.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  37.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  37.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  25.45 
 
 		 677 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  37.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  37.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  37.78 
 
 		 571 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  23.32 
 
 		 684 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.07 
 
 		 604 aa  47.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  33.87 
 
 		 623 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  30.26 
 
 		 600 aa  47.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  23.72 
 
 		 678 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  24.74 
 
 		 677 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.79 
 
 		 583 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf347  DNA primase  38.16 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.603388  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  24.94 
 
 		 677 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  26.23 
 
 		 617 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.79 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  32.43 
 
 		 544 aa  46.6  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  30.97 
 
 		 653 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  31.17 
 
 		 703 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  21.88 
 
 		 574 aa  45.8  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  34.67 
 
 		 660 aa  45.8  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  21.88 
 
 		 574 aa  45.8  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  29.47 
 
 		 673 aa  45.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  27.17 
 
 		 601 aa  45.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  40 
 
 		 552 aa  45.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  29.31 
 
 		 564 aa  45.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4594  DNA primase  26.17 
 
 		 632 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  28.5 
 
 		 593 aa  45.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  22.09 
 
 		 686 aa  45.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  32.79 
 
 		 587 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  28.89 
 
 		 530 aa  44.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1574  DNA primase  28.95 
 
 		 705 aa  44.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0270687  normal  0.0108391 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  30.68 
 
 		 606 aa  44.7  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  42.22 
 
 		 601 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  29.73 
 
 		 599 aa  44.3  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  28.38 
 
 		 560 aa  44.3  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  35.29 
 
 		 620 aa  44.3  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  32.47 
 
 		 588 aa  44.3  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl269  DNA primase  32.89 
 
 		 626 aa  43.9  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000470008  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  40.91 
 
 		 535 aa  43.9  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  22.35 
 
 		 601 aa  43.9  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  37.78 
 
 		 640 aa  43.9  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>