30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1073 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1073  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  201  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00152344  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0572  sporulation protein YqfC  57.28 
 
 
107 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3072  sporulation protein YqfC  47.06 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000306871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1568  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.612892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1338  hypothetical protein  43.37 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.216422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2486  hypothetical protein  34.12 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00119339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2050  hypothetical protein  40.96 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0130  sporulation protein YqfC  36.26 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000159911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1196  sporulation protein YqfC  40.48 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000209713  normal  0.440989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0591  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0201866  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1022  sporulation protein YqfC  37.97 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1270  sporulation protein YqfC  34.12 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0178006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12620  sporulation protein YqfC  34.52 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2428  sporulation protein YqfC  34.18 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000133463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3033  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4158  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4206  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4044  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.925602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4532  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4440  sporulation protein YqfC  28.24 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000126571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4329  sporulation protein YqfC  28.24 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5951e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4054  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.791546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4388  hypothetical protein  27.91 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0812  sporulation protein YqfC  28.24 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0459506  decreased coverage  3.8970900000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4424  sporulation protein YqfC  28.24 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.503705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2278  sporulation protein YqfC  37.5 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1993  sporulation protein YqfC  36.25 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4282  sporulation protein YqfC  29.41 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1987  hypothetical protein  27.38 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2613  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>