More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0648 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0648  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 546 aa  1133    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1255  glutamyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 552 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1067  glutamyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000513816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 500 aa  256  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 493 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 503 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 490 aa  234  3e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 493 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 492 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 481 aa  233  6e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 493 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 502 aa  233  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 511 aa  229  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 493 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 493 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 489 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 514 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 493 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 505 aa  228  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 493 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 502 aa  228  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 480 aa  228  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 488 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 509 aa  227  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 493 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 500 aa  226  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 485 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 489 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 484 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 486 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 487 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 502 aa  220  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 494 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 480 aa  220  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 506 aa  219  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 494 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 494 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 488 aa  218  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 506 aa  217  4e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 484 aa  217  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 501 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  30.08 
 
 		 495 aa  216  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01030  Glutamyl-tRNA synthetase, putative  41.92 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 485 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 482 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 485 aa  213  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 494 aa  212  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 512 aa  212  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 491 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 490 aa  211  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 494 aa  210  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 482 aa  209  8e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 491 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 479 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 517 aa  207  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 488 aa  206  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 485 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 485 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 485 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 485 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 485 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 485 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57984  glutamyl-tRNA synthetase, mitochondrial  40.07 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.604011  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 490 aa  204  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 507 aa  203  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 483 aa  203  7e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 494 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  32.51 
 
 		 588 aa  203  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 491 aa  203  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 477 aa  200  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 469 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>