More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0691 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0691  dihydrouridine synthase, DuS  100 
 
 		 340 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23640  hypothetical protein  49.18 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.963568  hitchhiker  0.00882346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0906  NifR3/Smm1 family protein  47.21 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1057  dihydrouridine synthase, DuS  46.65 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2003  hypothetical protein  47.87 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1979  dihydrouridine synthase, DuS  47.77 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.160423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2859  dihydrouridine synthase, DuS  48.24 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  hitchhiker  0.0000000322781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2169  dihydrouridine synthase family protein  47.63 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2727  dihydrouridine synthase, DuS  48.2 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165844  normal  0.161387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1255  dihydrouridine synthase, DuS  50.33 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0939064  normal  0.0146388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1544  dihydrouridine synthase DuS  48.85 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.177604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1786  dihydrouridine synthase DuS  47.92 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000927227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3779  dihydrouridine synthase, DuS  48.09 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.605744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1981  NifR3/Smm1 family protein  47.77 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0473795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1512  dihydrouridine synthase DuS  47.13 
 
 		 323 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0251677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1882  dihydrouridine synthase, DuS  47.87 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2242  dihydrouridine synthase, DuS  48.24 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000197491  hitchhiker  0.000869385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1583  dihydrouridine synthase DuS  49.67 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.018372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2279  dihydrouridine synthase, DuS  44.9 
 
 		 314 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1635  hypothetical protein  48.24 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.270741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1351  dihydrouridine synthase, DuS  49.02 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3192  dihydrouridine synthase, DuS  48.34 
 
 		 342 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2338  putative tRNA-dihydrouridine synthase C, DuS  46.67 
 
 		 340 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135158  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1501  dihydrouridine synthase DuS  46.38 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1912  dihydrouridine synthase DuS  49.32 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.402938  normal  0.0330373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34320  tRNA-dihydrouridine synthase C  49.68 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2915  dihydrouridine synthase, DuS  48.68 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1847  dihydrouridine synthase DuS  47.39 
 
 		 340 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323112  normal  0.104761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5201  dihydrouridine synthase DuS  46.95 
 
 		 329 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02307  NifR3/Smm1 family protein  45.37 
 
 		 312 aa  262  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2544  dihydrouridine synthase DuS  48.38 
 
 		 338 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.542055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2006  NifR3/Smm1 family protein  45.21 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2697  dihydrouridine synthase DuS  45.54 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0155722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1303  NifR3/Smm1 family protein  45.11 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0734085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2581  dihydrouridine synthase DuS  45.87 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.601403  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2622  dihydrouridine synthase DuS  45.87 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0113547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1762  dihydrouridine synthase DuS  45.87 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0181198  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1304  RecR protein  48.04 
 
 		 318 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113352  normal  0.0322688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3425  dihydrouridine synthase, DuS  46.23 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2309  dihydrouridine synthase, DuS  44.09 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2261  dihydrouridine synthase, DuS  45.21 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.214187  normal  0.298412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2452  dihydrouridine synthase, DuS  45.21 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3024  dihydrouridine synthase, DuS  45.68 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2333  dihydrouridine synthase, DuS  45.21 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.108163  normal  0.0297059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2414  dihydrouridine synthase, DuS  45.21 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2388  dihydrouridine synthase, DuS  45.42 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0313315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2886  dihydrouridine synthase, DuS  45.18 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.014767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1302  dihydrouridine synthase, DuS  46.67 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1998  dihydrouridine synthase DuS  45.97 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.774292  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02933  hypothetical protein  43.65 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2287  tRNA-dihydrouridine synthase C  43.87 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3266  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0659452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2364  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2521  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02069  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1518  dihydrouridine synthase DuS  44.37 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02028  hypothetical protein  44.37 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2274  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1355  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.41 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15198  hitchhiker  0.0054814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1508  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2320  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2887  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.41 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2413  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2808  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 312 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2409  tRNA-dihydrouridine synthase C  43.53 
 
 		 312 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.021708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2429  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002975  tRNA-dihydrouridine synthase C  43 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.386043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1533  tRNA-dihydrouridine synthase C  43.17 
 
 		 310 aa  235  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3625  dihydrouridine synthase DuS  37.7 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000203836  decreased coverage  0.0000000672077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1337  tRNA-dihydrouridine synthase C  42.9 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2504  tRNA-dihydrouridine synthase C  43.55 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2742  tRNA-dihydrouridine synthase C  43.55 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.212051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2152  tRNA-dihydrouridine synthase C  41.72 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2126  dihydrouridine synthase DuS  46.84 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2928  tRNA-dihydrouridine synthase C  43.05 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2410  tRNA-dihydrouridine synthase C  44.37 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148461  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1290  tRNA-dihydrouridine synthase C  40.26 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000404902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2307  dihydrouridine synthase, DuS  40.82 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.936931 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2004  tRNA-dihydrouridine synthase  40.44 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2324  dihydrouridine synthase, DuS  39.38 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0645  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  36.96 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.446085  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3447  TIM-barrel protein, nifR3 family  35.2 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2449  TIM-barrel protein  36.9 
 
 		 351 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3612  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.92 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0624  tRNA-dihydrouridine synthase C  50.63 
 
 		 158 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.011604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  32.18 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0242  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.91 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0191961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0273  nifR3 family TIM-barrel protein  29.91 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0425  NifR3 family TIM-barrel protein  34.38 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0176336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0030  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  36.5 
 
 		 370 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00690  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  36.07 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0441  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.25 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1325  nifR3 family TIM-barrel protein  35.1 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.544118  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0935  NifR3 family TIM-barrel protein  32.19 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.489775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3448  nifR3 family TIM-barrel protein  32.61 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0021  NifR3 family TIM-barrel protein  33.98 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2368  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.96 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03937  tRNA-dihydrouridine synthase B  36.74 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2418  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.96 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2685  nifR3 family TIM-barrel protein  34.27 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000366446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>