10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3174 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3174  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 309 aa  630  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.694919  normal  0.880565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2658  UbiA prenyltransferase  31.77 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4968  UbiA prenyltransferase  29.93 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293312  normal  0.100747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  27.42 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  29.75 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  25.69 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  28.95 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.85 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  26.7 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.9 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>