14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2251 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2251  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
752 aa  1565    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2866  hypothetical protein  26.26 
 
 
801 aa  177  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402668  normal  0.0376037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0480  hypothetical protein  23.49 
 
 
918 aa  87.8  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  29.87 
 
 
976 aa  71.6  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.62 
 
 
795 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1444  hypothetical protein  29.85 
 
 
807 aa  65.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.239906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1712  hypothetical protein  29.1 
 
 
807 aa  63.9  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0116958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
762 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2871  hypothetical protein  23.43 
 
 
705 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
779 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.33 
 
 
774 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0439  hypothetical protein  24.84 
 
 
348 aa  48.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  21.52 
 
 
795 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.11 
 
 
775 aa  44.3  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>