60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1193 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1193  protein of unknown function DUF540  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.436714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03620  hypothetical protein  32.89 
 
 		 217 aa  99  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  25.82 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  25.91 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  27.08 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  25.39 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  26.09 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  23.29 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  29.17 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  23.77 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  27.69 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  26.56 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  26.04 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10220  putative sulfate transport protein CysZ  24.83 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  25.52 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  25 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  24.89 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  23.21 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  24.75 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  26.2 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  22.62 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  23.73 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  28.37 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  23.83 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  20.92 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  22.95 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  21.14 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  25.82 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  23.53 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  20.24 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  24.69 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  24.39 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  24.39 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  24.39 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  24.39 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  24.39 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  29.35 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  25.42 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0416  protein of unknown function DUF540  21.34 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.881692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  24.59 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  22.88 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  20.85 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  21.6 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  22.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  22.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  22.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  21.2 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  22.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  22.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  22.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  22.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  22.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  28.08 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  21.91 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  21.78 
 
 		 241 aa  42.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  24.87 
 
 		 251 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  24.68 
 
 		 234 aa  42  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>