29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0575 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0575  protein of unknown function DUF458  100 
 
 
161 aa  339  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7091  protein of unknown function DUF458  67.31 
 
 
157 aa  222  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00936818  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1009  protein of unknown function DUF458  62.58 
 
 
157 aa  209  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.889316  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21710  hypothetical protein  28.79 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.761534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0112  protein of unknown function DUF458  28.23 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.38538  hitchhiker  0.00353815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2225  hypothetical protein  29.29 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000107696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2110  protein of unknown function DUF458  32.26 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1348  protein of unknown function DUF458  28.46 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.187185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0078  hypothetical protein  25.66 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0053  hypothetical protein  28.76 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0054  hypothetical protein  27.42 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000282525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0046  hypothetical protein  26.4 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0166  protein of unknown function DUF458  23.24 
 
 
170 aa  60.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0164  hypothetical protein  29.17 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3743  hypothetical protein  30.3 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3727  hypothetical protein  30.3 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4000  hypothetical protein  30.3 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3895  hypothetical protein  30.3 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4198  hypothetical protein  30.3 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3812  hypothetical protein  31.52 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4034  hypothetical protein  29.7 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4105  hypothetical protein  29.7 
 
 
172 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4088  hypothetical protein  29.7 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1152  hypothetical protein  29.7 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0047  protein of unknown function DUF458  28 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1245  hypothetical protein  28.79 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1210  hypothetical protein  28.79 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2687  hypothetical protein  27.97 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3603  protein of unknown function DUF458  25.6 
 
 
157 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000214172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>