75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0490 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0490  deoxyhypusine synthase  100 
 
 
324 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1939  deoxyhypusine synthase  82.41 
 
 
324 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.952214  normal  0.0341387 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1873  deoxyhypusine synthase  80.5 
 
 
324 aa  565  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0287  deoxyhypusine synthase  82.87 
 
 
326 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  0.0769858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2810  deoxyhypusine synthase  81.25 
 
 
322 aa  538  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00515  hypothetical protein  80.06 
 
 
324 aa  531  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1628  deoxyhypusine synthase  68.29 
 
 
348 aa  474  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2079  deoxyhypusine synthase  65.54 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.362575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2448  deoxyhypusine synthase  65.43 
 
 
325 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.914534  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3460  deoxyhypusine synthase  69.04 
 
 
324 aa  464  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0388485  normal  0.010011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3346  deoxyhypusine synthase  65.74 
 
 
325 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1218  deoxyhypusine synthase  67.59 
 
 
326 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3399  deoxyhypusine synthase  66.98 
 
 
326 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3135  deoxyhypusine synthase  63.55 
 
 
345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3197  deoxyhypusine synthase  56.6 
 
 
340 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3292  deoxyhypusine synthase  56.6 
 
 
340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0554122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3097  deoxyhypusine synthase  55.97 
 
 
340 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0229205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1276  deoxyhypusine synthase-like protein  28.93 
 
 
390 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0029  putative deoxyhypusine synthase  25.97 
 
 
311 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0184  putative deoxyhypusine synthase  25.41 
 
 
312 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1896  deoxyhypusine synthase-like protein  28.7 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0708136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1485  deoxyhypusine synthase  28.13 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0390114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4976  deoxyhypusine synthase-like protein  26.97 
 
 
400 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1312  deoxyhypusine synthase  26.01 
 
 
367 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0118819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0154  putative deoxyhypusine synthase  25.41 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.124877  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2574  putative deoxyhypusine synthase  26.06 
 
 
336 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116993  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1200  putative deoxyhypusine synthase  24.6 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0061  putative deoxyhypusine synthase  25.32 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2484  deoxyhypusine synthase-like protein  25.8 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0928  deoxyhypusine synthase-like protein  24.52 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.646253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2699  deoxyhypusine synthase-like protein  26.76 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3109  deoxyhypusine synthase  25 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2235  deoxyhypusine synthase-like protein  25.8 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0578159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4663  deoxyhypusine synthase-like protein  27.19 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2349  putative deoxyhypusine synthase  24.84 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2546  putative deoxyhypusine synthase  25.62 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.482649 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2876  deoxyhypusine synthase-like protein  26.92 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2480  deoxyhypusine synthase-like protein  26.92 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1997  putative deoxyhypusine synthase  25 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.428923  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1329  putative deoxyhypusine synthase  26.21 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.644418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0073  deoxyhypusine synthase-like protein  26.41 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1464  deoxyhypusine synthase-like protein  23.7 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.781396  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2089  deoxyhypusine synthase-like protein  26.76 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2389  putative deoxyhypusine synthase  25.94 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.74286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1942  deoxyhypusine synthase  26.44 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1753  putative deoxyhypusine synthase  23.57 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000310195  normal  0.0979592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2038  putative deoxyhypusine synthase  26.14 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.1291  normal  0.264826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1946  Deoxyhypusine synthase  22.98 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0305286  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0166  deoxyhypusine synthase-like protein  24.84 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1799  putative deoxyhypusine synthase  24.57 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470031  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3738  Deoxyhypusine synthase  22.88 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0376  deoxyhypusine synthase-like protein  24.65 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1180  putative deoxyhypusine synthase  25.71 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0413  putative deoxyhypusine synthase  23.03 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2903  putative deoxyhypusine synthase  23.94 
 
 
322 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0839  deoxyhypusine synthase-like protein  24.92 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0732  deoxyhypusine synthase-like protein  24.92 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1171  putative deoxyhypusine synthase  22.59 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1868  deoxyhypusine synthase  24.13 
 
 
324 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0257  deoxyhypusine synthase-like protein  24.48 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0976  putative deoxyhypusine synthase  22.57 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0041  deoxyhypusine synthase  23.89 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46999  predicted protein  26.39 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.970399  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0783  putative deoxyhypusine synthase  21.45 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.363261  normal  0.028647 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02480  deoxyhypusine synthase, putative  22.88 
 
 
341 aa  56.2  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1970  putative deoxyhypusine synthase  22.02 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88952  predicted protein  23.57 
 
 
379 aa  52.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64572  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1473  putative deoxyhypusine synthase  24.26 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333563  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35514  predicted protein  21.21 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0201246  normal  0.36566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0861  putative deoxyhypusine synthase  22.41 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1539  putative deoxyhypusine synthase  22.68 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0815  putative deoxyhypusine synthase  22.22 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0648  putative deoxyhypusine synthase  22.97 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1142  putative deoxyhypusine synthase  21.09 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.280864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1136  putative deoxyhypusine synthase  22.3 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>