132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0367 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0367  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6188  hypothetical protein  31.71 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.19766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0070  hypothetical protein  29.36 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1933  hypothetical protein  27.12 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2225  hypothetical protein  35.14 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337676  normal  0.0689162 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4195  hypothetical protein  25.94 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2401  hypothetical protein  25.4 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 1033 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1153 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  37.74 
 
 		 1077 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.58 
 
 		 1043 aa  55.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 933 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1037 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 987 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1070 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0591  hypothetical protein  24.79 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 977 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0707  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1020 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1027 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1139 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 1047 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1057 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1084 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 1029 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1137 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1134 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 947 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1033 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1085 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1034 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0266  hypothetical protein  26.29 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  0.0704311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 992 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1099 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1006 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1082 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1012 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 1039 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  36.9 
 
 		 1127 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1064 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  31.07 
 
 		 1030 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1084 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1113 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1072 aa  48.5  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1056 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 1095 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1148 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1087 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1073 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1189 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1085 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 1144 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1006 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1064 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 962 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3525  TonB-dependent receptor, plug  29.13 
 
 		 1000 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1038 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 994 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1045 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1097 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1031 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0048  hypothetical protein  32.93 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 1081 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  30.7 
 
 		 925 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1079 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1095 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1008 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1038 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1059 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1010 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1055 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 780 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1010 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1023 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1136 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1020 aa  45.4  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  43.48 
 
 		 1024 aa  45.4  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 999 aa  45.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1065 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  33.67 
 
 		 1065 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 1029 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08806  hypothetical protein  23.85 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1017 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1154 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1066 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  32.04 
 
 		 1035 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  29.73 
 
 		 1123 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2992  hypothetical protein  26.12 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1128 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  31.37 
 
 		 979 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1135 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1116 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1021 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1106 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 979 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 1093 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 1065 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>