More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0180 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0180  phosphate transporter  100 
 
 
334 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0190  phosphate transporter  67.59 
 
 
336 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  51.94 
 
 
335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  53.61 
 
 
336 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  53.61 
 
 
336 aa  322  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  53.61 
 
 
336 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  53.17 
 
 
336 aa  319  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  52.01 
 
 
336 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  51.66 
 
 
336 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  52.94 
 
 
336 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  48.92 
 
 
335 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  50.76 
 
 
336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  49.07 
 
 
336 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  49.38 
 
 
336 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  49.38 
 
 
336 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  49.07 
 
 
336 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  48.77 
 
 
336 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  50.45 
 
 
352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  49.24 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  50.16 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  50.3 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4228  phosphate transporter  51.05 
 
 
352 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  48.99 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  50.45 
 
 
352 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  50.46 
 
 
336 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  49.1 
 
 
332 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  48.77 
 
 
336 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5348  phosphate transporter  50.78 
 
 
336 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  49.22 
 
 
336 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  49.22 
 
 
336 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  52.74 
 
 
334 aa  295  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  50.16 
 
 
336 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  50.16 
 
 
336 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  50.16 
 
 
336 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  47.9 
 
 
331 aa  295  6e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0559  phosphate transporter  50.31 
 
 
313 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  51.98 
 
 
338 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  51.22 
 
 
334 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  49.38 
 
 
336 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  49.38 
 
 
336 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  49.38 
 
 
336 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  49.38 
 
 
336 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  49.38 
 
 
336 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  49.38 
 
 
336 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  49.38 
 
 
354 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  49.38 
 
 
354 aa  291  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1414  phosphate transporter  50.45 
 
 
329 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  50.6 
 
 
336 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  49.39 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  49.39 
 
 
336 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  49.23 
 
 
336 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3161  phosphate transporter  50.6 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0717  phosphate transporter  50.3 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3605  phosphate transporter  49.1 
 
 
332 aa  282  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  44.21 
 
 
332 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  45.07 
 
 
333 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  43.28 
 
 
333 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0027  hypothetical protein  48.24 
 
 
331 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0028  hypothetical protein  48.24 
 
 
331 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  49.24 
 
 
334 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1792  phosphate transporter  50.32 
 
 
336 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  46.67 
 
 
332 aa  275  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0775  phosphate transporter  50.45 
 
 
328 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  47.42 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  45.96 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  43.07 
 
 
333 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  48.91 
 
 
334 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  49.09 
 
 
334 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  47.08 
 
 
336 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  41.79 
 
 
333 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  47.45 
 
 
337 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  47.04 
 
 
333 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  44.21 
 
 
335 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  44.21 
 
 
335 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  46.44 
 
 
332 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  46.87 
 
 
336 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  43.75 
 
 
335 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3131  phosphate transporter  48.55 
 
 
345 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  42.26 
 
 
354 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  41.44 
 
 
332 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  42.99 
 
 
329 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  49.04 
 
 
343 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8018  phosphate transporter  46.69 
 
 
335 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  44.21 
 
 
385 aa  258  8e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  41.72 
 
 
346 aa  258  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  45.7 
 
 
332 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  44.58 
 
 
370 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  48.71 
 
 
332 aa  256  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  44.51 
 
 
326 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0317  phosphate transporter family protein  45.07 
 
 
336 aa  255  8e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.178517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  44.71 
 
 
332 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  42.41 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  45.51 
 
 
333 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  48 
 
 
334 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  44.41 
 
 
336 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  44.85 
 
 
337 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  42.86 
 
 
338 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  47 
 
 
334 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  44.51 
 
 
334 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  45.71 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>