30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3792 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3792  stage II sporulation protein R  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0292  stage II sporulation protein R  41.28 
 
 
228 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0606  hypothetical protein  36.27 
 
 
211 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2185  stage II sporulation protein R  36.95 
 
 
209 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2475  stage II sporulation protein R  35.27 
 
 
209 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1920  stage II sporulation protein R  35.61 
 
 
232 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.336826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1953  hypothetical protein  33.7 
 
 
230 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00408816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4409  stage II sporulation protein R  33.72 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0458  pro-sigma-E processing factor spoIIR  33.79 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1068  stage II sporulation protein R  39.2 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000088447  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5450  putative stage II sporulation protein R  32.51 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000293533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5502  putative stage II sporulation protein R  32.04 
 
 
290 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000804595  unclonable  7.58815e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2869  hypothetical protein  33.54 
 
 
234 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000219294  hitchhiker  0.000000000000666906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0063  pro-sigma-E processing factor spoIIR  32.24 
 
 
188 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.241546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5125  sporulation stage II protein R  36 
 
 
286 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3848  sporulation stage II protein R  35.14 
 
 
293 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000147642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5505  putative stage II sporulation protein R  32.78 
 
 
291 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09170  Sporulation stage II protein R  38.73 
 
 
227 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5011  stage II sporulation protein R  32.6 
 
 
291 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5027  stage II sporulation protein R  32.78 
 
 
287 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.183388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5419  putative stage II sporulation protein R  32.6 
 
 
291 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.67457e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5570  stage II sporulation protein R  32.78 
 
 
288 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5176  stage II sporulation protein R  32.78 
 
 
288 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5454  stage II sporulation protein R, putative  32.78 
 
 
288 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.032522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1424  hypothetical protein  37.69 
 
 
212 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.202579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0854  hypothetical protein  33.6 
 
 
196 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.124118  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3320  stage II sporulation protein R  34.78 
 
 
254 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.270534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3433  stage II sporulation protein R  35.5 
 
 
287 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1551  stage II sporulation protein R  36.51 
 
 
199 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000282987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2778  stage II sporulation protein R  36.59 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>