More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3693 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3693  ribosomal protein L11  100 
 
 		 142 aa  285  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000590781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  75.35 
 
 		 141 aa  224  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  224  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  75.89 
 
 		 141 aa  222  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  75.89 
 
 		 141 aa  222  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  74.47 
 
 		 141 aa  216  7.999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 		 141 aa  215  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  75 
 
 		 141 aa  216  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  73.24 
 
 		 141 aa  210  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 142 aa  207  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  73.24 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  71.22 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 140 aa  203  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 140 aa  203  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 140 aa  203  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 		 141 aa  203  8e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  198  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  60.99 
 
 		 141 aa  189  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  61.15 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  186  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  62.14 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0159  50S ribosomal protein L11  65.73 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000114645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0202  50S ribosomal protein L11  64.34 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000393914  hitchhiker  0.0000945283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  56.74 
 
 		 141 aa  180  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  65.03 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  65.03 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  65.03 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  65.03 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2870  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000138901  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  59.12 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  61.54 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  61.54 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  61.54 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>