More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3654 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3654  ribosomal protein S14  100 
 
 		 56 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000678184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0771  30S ribosomal protein S14  83.93 
 
 		 61 aa  103  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000576242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0299  ribosomal protein S14  75 
 
 		 61 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000407212  normal  0.0939197 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1561  ribosomal protein S14  78.57 
 
 		 61 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000971035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2916  30S ribosomal protein S14  74.07 
 
 		 61 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0880  30S ribosomal protein S14  77.78 
 
 		 61 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2698  ribosomal protein S14  76.79 
 
 		 61 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1732  30S ribosomal protein S14  77.78 
 
 		 61 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000129581  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0228  ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0435  30S ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000657507  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1818  30S ribosomal protein S14  73.21 
 
 		 61 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0683  30S ribosomal protein S14  67.86 
 
 		 61 aa  89.4  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2447  SSU ribosomal protein S14P  66.07 
 
 		 61 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2264  30S ribosomal protein S14  71.43 
 
 		 61 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00143207  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2305  30S ribosomal protein S14  71.43 
 
 		 61 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00385731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0207  SSU ribosomal protein S14P  71.7 
 
 		 61 aa  87.8  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00665329  normal  0.463134 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2320  ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000205328  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl136  30S ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  86.7  9e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0994  30S ribosomal protein S14  68.52 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.106756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1752  30S ribosomal protein S14  62.5 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2761  ribosomal protein S14  62.5 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000281664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1239  SSU ribosomal protein S14P  67.92 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.362958  hitchhiker  0.000818098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0728  ribosomal protein S14  68.52 
 
 		 61 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0154  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5182  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220128  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0123  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000176609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0123  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0119  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6855200000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0117  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000493701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0144  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000518552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0123  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064934  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0239  30S ribosomal protein S14  69.81 
 
 		 61 aa  84.7  3e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0135  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0118  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000039135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0092  30S ribosomal protein S14  58.93 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0813012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0117  30S ribosomal protein S14  69.64 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2386  30S ribosomal protein S14  67.86 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2701  30S ribosomal protein S14  67.86 
 
 		 61 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1849  ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.94553e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2389  30S ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  84  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2142  SSU ribosomal protein S14P  71.7 
 
 		 61 aa  83.6  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4927  ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000398171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1568  30S ribosomal protein S14  67.92 
 
 		 61 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.837036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1511  ribosomal protein S14  58.93 
 
 		 61 aa  83.6  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0120  30S ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0124  30S ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf429  ribosomal protein S14  66.07 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0238  ribosomal protein S14  64.15 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.267646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0673  30S ribosomal protein S14  57.14 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.676771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1172  30S ribosomal protein S14  64.81 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992885  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2244  30S ribosomal protein S14  57.14 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00320341  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1148  ribosomal protein S14  60.71 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000324715  hitchhiker  0.00150384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0721  30S ribosomal protein S14  58.93 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4013  30S ribosomal protein S14  60.71 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000290289  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2165  ribosomal protein S14  62.5 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0123488  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09870  SSU ribosomal protein S14P  62.5 
 
 		 61 aa  80.1  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000893021  hitchhiker  0.0000177439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0071  30S ribosomal protein S14  60.71 
 
 		 61 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.689947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3900  30S ribosomal protein S14  66.67 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01300  ribosomal protein S14  66.04 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2844  30S ribosomal protein S14  64.29 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0517993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0639  30S ribosomal protein S14  64.29 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000559173  hitchhiker  0.00000000926519 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0777  ribosomal protein S14  62.26 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1079  30S ribosomal protein S14  64.29 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1470  30S ribosomal protein S14  64.29 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000297211  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20740  30S ribosomal protein S14  58.93 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.905824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2894  ribosomal protein S14  62.5 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0097  ribosomal protein S14p/S29e  58.93 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.316233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0780  30S ribosomal protein S14  60.71 
 
 		 61 aa  77.4  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23340  SSU ribosomal protein S14P  58.93 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000971203  hitchhiker  0.00000013579 
 
 
-
 
NC_002936  DET0487  30S ribosomal protein S14  55.56 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000160451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0299  30S ribosomal protein S14  55.36 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0322273  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_429a  30S ribosomal protein S14  55.56 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000656242  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0464  30S ribosomal protein S14  55.56 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000329078  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0490  ribosomal protein S14  66.04 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0863269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2052  ribosomal protein S14  55.36 
 
 		 61 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0017138  normal  0.052251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1099  ribosomal protein S14  53.57 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0714  30S ribosomal protein S14  57.14 
 
 		 61 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000170249  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1894  30S ribosomal protein S14  60.38 
 
 		 61 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000079988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0319  30S ribosomal protein S14  53.7 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3710  ribosomal protein S14  54.72 
 
 		 61 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0411  ribosomal protein S14  58.49 
 
 		 61 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  53.57 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1057  30S ribosomal protein S14  58.49 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0000711569  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5034  30S ribosomal protein S14  58.49 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000580616  normal  0.481269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1028  30S ribosomal protein S14  58.49 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000000564921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0966  30S ribosomal protein S14  56.86 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5137  ribosomal protein S14  56.6 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1045  30S ribosomal protein S14  58.49 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000910706  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1335  30S ribosomal protein S14  58.49 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0072  30S ribosomal protein S14  57.14 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.15286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1405  ribosomal protein S14  56.6 
 
 		 61 aa  73.9  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0946  30S ribosomal protein S14  58.93 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0139949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3315  30S ribosomal protein S14  58.93 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000449399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3418  ribosomal protein S14  54.72 
 
 		 61 aa  73.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2633  SSU ribosomal protein S14P  58.49 
 
 		 61 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0670776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23670  SSU ribosomal protein S14P  52.83 
 
 		 61 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  53.57 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3892  SSU ribosomal protein S14P  53.57 
 
 		 61 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264a  30S ribosomal protein S14  53.57 
 
 		 61 aa  73.6  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0600  ribosomal protein S14  56.6 
 
 		 61 aa  73.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.516663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>