53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3449 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3449  asparagine synthetase AsnA  100 
 
 
337 aa  694    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2575  asparagine synthetase AsnA  66.67 
 
 
336 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00216913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0069  asparagine synthetase AsnA  63.99 
 
 
340 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000244111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1945  asparagine synthetase AsnA  63.99 
 
 
336 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2233  asparagine synthetase AsnA  63.69 
 
 
336 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0946  aspartate/ammonia ligase  61.19 
 
 
337 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1703  asparagine synthetase AsnA  57.06 
 
 
335 aa  412  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1786  asparagine synthetase AsnA  58.98 
 
 
353 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000156633  hitchhiker  2.77928e-18 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1588  aspartate/ammonia ligase  58.38 
 
 
336 aa  408  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1885  asparagine synthetase AsnA  59.88 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000727816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24030  asparagine synthetase AsnA  54.65 
 
 
335 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.528692  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1819  asparagine synthetase AsnA  58.72 
 
 
327 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.631183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1427  asparagine synthetase AsnA  58.72 
 
 
327 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1808  asparagine synthetase AsnA  58.41 
 
 
327 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1928  asparagine synthetase AsnA  58.41 
 
 
327 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3523  asparagine synthetase AsnA  59.55 
 
 
327 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1880  asparagine synthetase AsnA  58.41 
 
 
327 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.701905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1673  asparagine synthetase AsnA  58.41 
 
 
327 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1655  asparagine synthetase AsnA  58.41 
 
 
327 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1620  asparagine synthetase AsnA  58.41 
 
 
327 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1853  asparagine synthetase AsnA  58.1 
 
 
327 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.04315e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1672  asparagine synthetase AsnA  57.19 
 
 
327 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.408642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1444  asparagine synthetase AsnA  55.56 
 
 
336 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0084  asparagine synthetase AsnA  52.87 
 
 
333 aa  364  1e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0372  asparagine synthetase AsnA  50.31 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0817  asparagine synthetase AsnA  51.68 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.321948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0424  asparagine synthetase AsnA  48.89 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.543605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0450  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  305  7e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000314133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4112  asparagine synthetase AsnA  49.84 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0106172  normal  0.169697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4120  asparagine synthetase AsnA  49.04 
 
 
330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0853611  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5180  asparagine synthetase AsnA  49.52 
 
 
330 aa  301  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0230028  normal  0.241744 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4223  aspartate/ammonia ligase  49.52 
 
 
330 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3960  asparagine synthetase AsnA  49.52 
 
 
330 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.138328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4250  asparagine synthetase AsnA  49.52 
 
 
330 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0372107 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1440  asparagine synthetase AsnA  47.04 
 
 
333 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.797246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4177  asparagine synthetase AsnA  49.52 
 
 
330 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.13025  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4104  asparagine synthetase AsnA  48.73 
 
 
330 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000041544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03628  asparagine synthetase AsnA  49.52 
 
 
330 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.312076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4260  asparagine synthetase AsnA  49.2 
 
 
330 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.148939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03572  hypothetical protein  49.52 
 
 
330 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4210  asparagine synthetase AsnA  48.73 
 
 
330 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4269  asparagine synthetase AsnA  48.73 
 
 
330 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.179504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4089  asparagine synthetase AsnA  48.73 
 
 
330 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4160  asparagine synthetase AsnA  48.73 
 
 
330 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.340951  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4535  asparagine synthetase AsnA  48.57 
 
 
330 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4245  asparagine synthetase AsnA  48.57 
 
 
330 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4905  asparagine synthetase AsnA  49.68 
 
 
330 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000321879  hitchhiker  0.000612587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4214  asparagine synthetase AsnA  47.92 
 
 
330 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0003  asparagine synthetase AsnA  47.92 
 
 
330 aa  292  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.52429  normal  0.646496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0003  asparagine synthetase AsnA  47.92 
 
 
330 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000347674  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44902  predicted protein  44 
 
 
382 aa  285  5.999999999999999e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0576  asparagine synthetase AsnA  42.01 
 
 
379 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18911  aspartate--ammonia ligase  39.66 
 
 
387 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>