More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1922 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1922  ABC transporter related  100 
 
 		 520 aa  1035    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  44.86 
 
 		 628 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 626 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 626 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 		 626 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 626 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0243  ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 		 626 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.592514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 626 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 626 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0208  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  41.98 
 
 		 636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  43.47 
 
 		 640 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 626 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  36.49 
 
 		 635 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  38.83 
 
 		 644 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 767 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  37.67 
 
 		 666 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 		 659 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  36.83 
 
 		 645 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 632 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.97 
 
 		 634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  35.81 
 
 		 634 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.48 
 
 		 668 aa  240  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 536 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 641 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 644 aa  239  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  35.83 
 
 		 658 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.98 
 
 		 649 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 644 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 662 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 659 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 636 aa  237  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 640 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 658 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 658 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  38.25 
 
 		 541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  37.67 
 
 		 638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  35.03 
 
 		 658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  34.13 
 
 		 649 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  35.12 
 
 		 636 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  37.69 
 
 		 541 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  35 
 
 		 627 aa  231  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  35.14 
 
 		 639 aa  230  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  33.78 
 
 		 639 aa  229  8e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  35.87 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  36.02 
 
 		 672 aa  228  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 		 645 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  35.12 
 
 		 643 aa  226  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.27 
 
 		 690 aa  223  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  35.41 
 
 		 581 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  31.54 
 
 		 648 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  35.67 
 
 		 620 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.15 
 
 		 709 aa  222  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  31.27 
 
 		 641 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.21 
 
 		 659 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  31.54 
 
 		 648 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  36.34 
 
 		 641 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  30.73 
 
 		 645 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 644 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.88 
 
 		 564 aa  220  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  32.25 
 
 		 649 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  32.88 
 
 		 646 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  35.85 
 
 		 630 aa  216  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  35.58 
 
 		 630 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  35.71 
 
 		 642 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  35.62 
 
 		 626 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  35.71 
 
 		 642 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.51 
 
 		 656 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 638 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  35.28 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  33.86 
 
 		 632 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  31.44 
 
 		 714 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  35.33 
 
 		 649 aa  211  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  32.16 
 
 		 663 aa  210  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.5 
 
 		 575 aa  210  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.85 
 
 		 551 aa  210  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  32.16 
 
 		 663 aa  209  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.16 
 
 		 549 aa  209  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  33.59 
 
 		 547 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  34.83 
 
 		 643 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  31.88 
 
 		 685 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  33.15 
 
 		 634 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  36.49 
 
 		 667 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  34.18 
 
 		 637 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  30.18 
 
 		 659 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  32.38 
 
 		 569 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  30.75 
 
 		 561 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  31.99 
 
 		 545 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 		 560 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  35.31 
 
 		 631 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 632 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  32.87 
 
 		 640 aa  206  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  35.22 
 
 		 631 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  32.34 
 
 		 667 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 631 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 631 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 631 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 631 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  33.87 
 
 		 535 aa  203  7e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>