154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1700 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1700  non-haem haloperoxidase family protein  100 
 
 
79 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  95.52 
 
 
270 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  70.15 
 
 
269 aa  103  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1575  alpha/beta hydrolase fold protein  56.06 
 
 
271 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  52.31 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 
269 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  49.21 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  49.21 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  49.21 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  49.21 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  49.21 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  49.21 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  47.62 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  43.94 
 
 
305 aa  66.6  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  44.44 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  44.44 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 
288 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  41.54 
 
 
278 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  43.75 
 
 
278 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  43.75 
 
 
278 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  43.75 
 
 
278 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  43.75 
 
 
278 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  43.75 
 
 
278 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  42.19 
 
 
278 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  42.19 
 
 
273 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1401  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  38.71 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
267 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
287 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
301 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
297 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
274 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 
257 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  35.48 
 
 
273 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
317 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
255 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
282 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
276 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
279 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 
316 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  38.81 
 
 
272 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
278 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
278 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
281 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
297 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
260 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
266 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2556  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
291 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 
350 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  34.85 
 
 
301 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
334 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  34.85 
 
 
301 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
286 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  34.85 
 
 
303 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
274 aa  43.9  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
279 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  35.94 
 
 
272 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  34.85 
 
 
301 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
285 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
340 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
340 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
340 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
272 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0781  abhydrolase  30.16 
 
 
208 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
269 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
278 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
279 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
257 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
272 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
277 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  35.09 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30.65 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  37.88 
 
 
280 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
340 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
290 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
269 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.5 
 
 
285 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
272 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
273 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  37.1 
 
 
303 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  32.81 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  37.1 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
272 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  38.71 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
272 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
275 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
254 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 
302 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  43.18 
 
 
336 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
286 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>