More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1614 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1614  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000284437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2512  glycosyl transferase family 51  38.46 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  42.01 
 
 		 765 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  46.9 
 
 		 765 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  46.9 
 
 		 784 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  45.52 
 
 		 760 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  41.81 
 
 		 656 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  43.45 
 
 		 775 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  39.32 
 
 		 705 aa  138  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  46.85 
 
 		 795 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  41.14 
 
 		 744 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  42.57 
 
 		 708 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  36.14 
 
 		 667 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  41.14 
 
 		 701 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0041  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 		 643 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0770668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  46.15 
 
 		 734 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0041  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 		 643 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000612567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  46.97 
 
 		 770 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  44.94 
 
 		 769 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  46.15 
 
 		 720 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 		 704 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  45.45 
 
 		 732 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  44.68 
 
 		 720 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  45.45 
 
 		 739 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  47.89 
 
 		 669 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  43.87 
 
 		 790 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  44.06 
 
 		 744 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  48.41 
 
 		 750 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0458  glycosyl transferase family protein  44.2 
 
 		 258 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000195671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  37.68 
 
 		 705 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  37.68 
 
 		 705 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  37.68 
 
 		 705 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  40.57 
 
 		 693 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  37.68 
 
 		 705 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  46.85 
 
 		 835 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  42.66 
 
 		 714 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  37.68 
 
 		 705 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  38.19 
 
 		 649 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  37.68 
 
 		 705 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  42.66 
 
 		 714 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  45.19 
 
 		 779 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  42.67 
 
 		 662 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0379  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 		 635 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0579  penicillin-binding domain protein  43.48 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000296239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0617  penicillin-binding domain protein  43.48 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4759  penicillin-binding domain protein  43.48 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868977  unclonable  4.4469700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0597  penicillin-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000108833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0512  penicillin-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000617961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0455  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.48 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0451  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.48 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000185121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0543  penicillin-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000216504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.27 
 
 		 648 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  44.76 
 
 		 735 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  44.76 
 
 		 757 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0543  penicillin-binding domain protein  43.48 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.7837e-60 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  42.66 
 
 		 728 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  43.36 
 
 		 727 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  43.36 
 
 		 727 aa  131  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  45.19 
 
 		 776 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  43.36 
 
 		 768 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  47.62 
 
 		 730 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  47.62 
 
 		 763 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  43.36 
 
 		 728 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  44.06 
 
 		 724 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  43.36 
 
 		 724 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1213  glycosyl transferase family 51  42.16 
 
 		 985 aa  131  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  42.58 
 
 		 796 aa  131  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  44.06 
 
 		 851 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  44.06 
 
 		 851 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  44.06 
 
 		 851 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  45.14 
 
 		 905 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  45.89 
 
 		 832 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.23 
 
 		 705 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.68 
 
 		 817 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  35.44 
 
 		 746 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  43.95 
 
 		 804 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  35.92 
 
 		 705 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0040  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 		 686 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  45.45 
 
 		 850 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  44.9 
 
 		 626 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  45.45 
 
 		 759 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  33.17 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  42.86 
 
 		 781 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0466  glycosyl transferase family protein  44.2 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000321197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  42.66 
 
 		 718 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  44.06 
 
 		 769 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  44.06 
 
 		 760 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.41 
 
 		 833 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1108  penicillin-binding protein 1A  46.1 
 
 		 846 aa  129  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  47.14 
 
 		 855 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  40.4 
 
 		 862 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  45.07 
 
 		 712 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  39.01 
 
 		 746 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0806  glycosyl transferase family protein  45.75 
 
 		 680 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  43.42 
 
 		 807 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  43.36 
 
 		 758 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  44.37 
 
 		 850 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  44.37 
 
 		 850 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  43.36 
 
 		 803 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  45.27 
 
 		 803 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>