63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0040 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0111833  normal  0.897569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0043  tRNA-Glu  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000374465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t37  tRNA-Glu  95.83 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0044  tRNA-Glu  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000772538  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0012  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0022  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000000692994  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  94.34 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0010  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0004  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0082  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0019  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0048  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0030  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0047  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0011  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.406571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0014  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10740  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0961043  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1163  tRNA-Glu  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.77096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0084  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0017  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>