31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0769 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  99.07 
 
 
1398 bp  2668    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  99.43 
 
 
1398 bp  2708    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  99.07 
 
 
1398 bp  2668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2325    99.57 
 
 
1402 bp  2710    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230471  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  99.07 
 
 
1398 bp  2668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  99 
 
 
1398 bp  2660    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  98.78 
 
 
1398 bp  2637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  98.5 
 
 
1401 bp  2597    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  99.93 
 
 
1398 bp  2763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  100 
 
 
1398 bp  2771    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  98.64 
 
 
1398 bp  2621    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  99.93 
 
 
1398 bp  2763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1078    98.76 
 
 
1459 bp  2714    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000154685  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0883    98.78 
 
 
1399 bp  2631    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  100 
 
 
1398 bp  2771    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0769    100 
 
 
3878 bp  7688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.379253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0710    99.22 
 
 
1408 bp  2654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  99.36 
 
 
1398 bp  2700    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  99.92 
 
 
1332 bp  2625    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  99.28 
 
 
1398 bp  2692    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0389    99.79 
 
 
1400 bp  2736    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.044301  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  99.07 
 
 
1398 bp  2668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  99.93 
 
 
1398 bp  2763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  99.07 
 
 
1398 bp  2668    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  97.3 
 
 
390 bp  196  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  83.96 
 
 
1326 bp  151  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  83.49 
 
 
1398 bp  143  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2133    93.22 
 
 
459 bp  85.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00859021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  91.67 
 
 
2544 bp  79.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  95.56 
 
 
2574 bp  73.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  92.68 
 
 
2556 bp  58  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>