17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0313 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 63 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  73.02 
 
 		 63 aa  97.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  66.67 
 
 		 63 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  69.84 
 
 		 63 aa  90.5  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  65.08 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  63.49 
 
 		 63 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  65.08 
 
 		 63 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  41.18 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.79 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  40.35 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  32.73 
 
 		 60 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0267  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.43 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0300363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 51 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0238  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>