37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0026 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0026  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0042  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 84 bp  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07723  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0072  tRNA-Tyr  91.46 
 
 		 81 bp  99.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2231  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000893857  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2193  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000544393  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1328  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.044502  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1675  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000825492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0010  tRNA-Tyr  97.67 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000473639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0058  tRNA-Tyr  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401108  normal  0.738165 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.63004  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0437  tRNA-Tyr  97.5 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253794  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1468  tRNA-Tyr  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000829322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1717  tRNA-Tyr  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000393409  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  86.57 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0008  tRNA-Tyr  91.49 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  89.36 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  87.72 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tTyr01  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17640  tRNA-Tyr  84.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0013  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000305155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>