153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0318 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0318  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 387 aa  793    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000964378  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0695  immunoreactive 43 kDa antigen PG32  28.28 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.0000000023123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  35.04 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  32.69 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  35.8 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_002950  PG0694  immunoreactive 42 kDa antigen PG33  32.19 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.0000000023367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 372 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  34.31 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  29.57 
 
 		 229 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  27.08 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  26.85 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1558  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0671389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 260 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  29.57 
 
 		 229 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  35.23 
 
 		 201 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 202 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 202 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  30.38 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  40 
 
 		 201 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 201 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.83 
 
 		 201 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 202 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 202 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  31.3 
 
 		 233 aa  53.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 229 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 666 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  29.67 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  27.37 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.09 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  29.23 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 		 1026 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  28.16 
 
 		 478 aa  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  27.37 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  37.97 
 
 		 205 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  31.33 
 
 		 189 aa  49.7  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  26.43 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.12 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  26.98 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  35.8 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  26.06 
 
 		 212 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.44 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  28.24 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  28.26 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  34.74 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  30.85 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  30.38 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  27.36 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  32.22 
 
 		 196 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  27.38 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  34.57 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 261 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  31.76 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  31.76 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  32.18 
 
 		 222 aa  46.2  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.18 
 
 		 321 aa  46.2  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  27.36 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  27.06 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  31.25 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  26.59 
 
 		 208 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0462  OmpA family protein  32.97 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  30.56 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  31.25 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  26.19 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  32.05 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  27.18 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 198 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3487  OmpA/MotB domain-containing protein  33.75 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.662497  normal  0.283139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>