137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0278 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0278  secreted protein  100 
 
 		 273 aa  567  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000164081  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08806  hypothetical protein  53.81 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2401  hypothetical protein  45.45 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09688  hypothetical protein  24.9 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1064 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1071 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1016 aa  58.9  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1073 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1064 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1082 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09683  hypothetical protein  28.35 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 999 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 987 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1062 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1031 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1099 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  30.97 
 
 		 1018 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 1008 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 994 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1028 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1021 aa  52.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 1037 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1003 aa  52.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1084 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1064 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1057 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1107 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0070  hypothetical protein  22.31 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1120 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  25.89 
 
 		 1095 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1010 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 998 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1027 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  28.81 
 
 		 979 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1047 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 1038 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1653  hypothetical protein  26.52 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1117 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 777 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1101 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1065 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  28.57 
 
 		 829 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  32.46 
 
 		 808 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1023 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1010 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1077 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1136 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1004 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1004 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  35.34 
 
 		 914 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 1144 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1019 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 780 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1154 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1050 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1188 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1014 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1075 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1051 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1050 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1008 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 979 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1135 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1084 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1110 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1047 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  29.36 
 
 		 828 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1134 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1052 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1043 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1037 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1072 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1023 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1219 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 997 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1059 aa  45.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1070 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1114 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1099 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1062 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 873 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1033 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1164 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 1098 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1085 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1034 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 922 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1769  hypothetical protein  30.11 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1168 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 999 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1097 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 971 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 1036 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1006 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1027 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1154 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1094 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1127 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>