28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1709 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1709  50S ribosomal protein L12P  100 
 
 		 108 aa  203  8e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.49137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1699  50S ribosomal protein L12P  68.66 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0899103 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0878  50S ribosomal protein L12P  59.26 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0720  50S ribosomal protein L12P  71.43 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0621  50S ribosomal protein L12P  69.64 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0784  50S ribosomal protein L12P  67.86 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1637  50S ribosomal protein L12P  64.29 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.461477  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1314  ribosomal protein 60S  60.71 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0415  50S ribosomal protein L12P  59.26 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0612  50S ribosomal protein L12P  62 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000227092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3520  ribosomal protein 60S  54.55 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.107265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1519  ribosomal protein 60S  54.55 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1419  50S ribosomal protein L12P  50 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.893644  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0256  50S ribosomal protein L12P  54.9 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0165  50S ribosomal protein L12P  51.85 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.589504 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0860  ribosomal protein 60S  51.79 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2249  50S ribosomal protein L12P  51.85 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  unclonable  0.0000000000341588  normal  0.119729 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0187  50S ribosomal protein L12P  56.36 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0654  50S ribosomal protein L12P  47.22 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00068543  normal  0.300749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1948  50S ribosomal protein L12P  53.85 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0442001  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2533  50S ribosomal protein L12P  56 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386824  normal  0.269455 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1579  50S ribosomal protein L12P  51.85 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00723578  hitchhiker  0.00569921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0374  50S ribosomal protein L12P  52.94 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2184  ribosomal protein 60S  54 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.603129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1261  50S ribosomal protein L12P  53.06 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0732344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0695  50S ribosomal protein L12P  53.06 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1415  50S ribosomal protein L12P  53.06 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1271  50S ribosomal protein L12P  46.94 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>