More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0281 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0281  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
358 aa  731    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413141 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.43 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  55.49 
 
 
350 aa  381  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1749  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.87 
 
 
345 aa  332  5e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172136  normal  0.622284 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.29 
 
 
366 aa  332  5e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0378  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50 
 
 
349 aa  332  5e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  0.126735 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1129  translation factor SUA5  50.87 
 
 
342 aa  331  1e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.712413 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1345  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.85 
 
 
358 aa  330  2e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.61 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.29 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.84 
 
 
335 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.53 
 
 
338 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.94 
 
 
354 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  44.1 
 
 
352 aa  293  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1773  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.64 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.31 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.26 
 
 
331 aa  282  8.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.72 
 
 
348 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  42.9 
 
 
351 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.8 
 
 
358 aa  279  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.25 
 
 
335 aa  279  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.35 
 
 
346 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.35 
 
 
346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.35 
 
 
346 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.88 
 
 
359 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.59 
 
 
347 aa  265  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  42.15 
 
 
350 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  45.05 
 
 
346 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.57 
 
 
364 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.3 
 
 
356 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.81 
 
 
341 aa  259  7e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.35 
 
 
355 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.06 
 
 
349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.37 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.79 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.61 
 
 
352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2862  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.03 
 
 
367 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.27 
 
 
343 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
348 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.62 
 
 
344 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.61 
 
 
346 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.79 
 
 
316 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33949  predicted protein  43.48 
 
 
387 aa  238  8e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  41.39 
 
 
367 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.47 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.33 
 
 
318 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  39.16 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.23 
 
 
317 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.7 
 
 
316 aa  206  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.92 
 
 
324 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.84 
 
 
347 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.85 
 
 
345 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  39.88 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10771  translation initiation protein Sua5 (AFU_orthologue; AFUA_2G09160)  37.28 
 
 
427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0142464  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.36 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1995  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.92 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1580  translation factor SUA5  37.46 
 
 
337 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.55 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  34.15 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.1 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  37.14 
 
 
321 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1246  putative translation factor (SUA5)  38.46 
 
 
334 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.377442  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0452  translation factor SUA5  36.18 
 
 
331 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  36.17 
 
 
323 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  35.78 
 
 
328 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.78 
 
 
328 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.12 
 
 
312 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.05 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  35.93 
 
 
364 aa  189  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.42 
 
 
330 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.54 
 
 
317 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  38.3 
 
 
335 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2190  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.7 
 
 
357 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.970506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2152  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.7 
 
 
357 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  39.82 
 
 
312 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3049  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.7 
 
 
323 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.268552  normal  0.430459 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  34.97 
 
 
315 aa  186  6e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  37.2 
 
 
327 aa  186  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.1 
 
 
338 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.04 
 
 
323 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0224928  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.21 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0598  hypothetical protein  35.96 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.86 
 
 
324 aa  182  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.19 
 
 
349 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0434156  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1247  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  41.12 
 
 
330 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2651  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.87 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2387  translation factor SUA5  38.15 
 
 
333 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2011  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  35.87 
 
 
342 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2622  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.87 
 
 
342 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.28 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5953  translation factor SUA5  35.67 
 
 
342 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.41 
 
 
331 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0695  translation factor SUA5  35.19 
 
 
346 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274507  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  35.78 
 
 
314 aa  179  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>