15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2377 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2377  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
221 aa  448  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2535  phospholipase/carboxylesterase  58.37 
 
 
221 aa  238  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.312015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2781  phospholipase/carboxylesterase  53.08 
 
 
221 aa  221  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0242  esterase/lipase, putative  50 
 
 
218 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0213  phospholipase/Carboxylesterase  51.46 
 
 
214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2028  esterase/lipase, putative  53.43 
 
 
211 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.102102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2647  hypothetical protein  32.28 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0089  hypothetical protein  34.02 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  28.37 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  24.82 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  24.11 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  28.89 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  23.33 
 
 
226 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  28.42 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  26.4 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>