55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1390 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  816    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  63.51 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  63.64 
 
 		 351 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  62.43 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  55.93 
 
 		 354 aa  346  5e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  48.12 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  29.88 
 
 		 365 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  27.96 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  25.88 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  27.69 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  27.61 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  32.48 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  29.46 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  30.95 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  40.26 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  30.95 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  25.89 
 
 		 340 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  41.03 
 
 		 338 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  41.03 
 
 		 343 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  31.43 
 
 		 347 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  24.22 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  24.22 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  30.71 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  27 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  24.22 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  30.71 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  30.71 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  32.86 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  26.25 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  24.76 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  30.71 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  32.86 
 
 		 347 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  26.25 
 
 		 326 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  24.62 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  31.97 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  25 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  31.29 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  31.29 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  25.87 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  26.33 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  31.29 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  34.33 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  31.29 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  31.29 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  25.08 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  25.08 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  25.08 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  25.08 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  25.08 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  25.08 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  31.47 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  26.67 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  35.06 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  35.79 
 
 		 349 aa  43.1  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>