20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0066 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0066  PilT protein domain protein  100 
 
 		 42 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  90.24 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  75.61 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  61.54 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  61.54 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  58.97 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  53.85 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  47.37 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  53.85 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  66.67 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  43.59 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  43.59 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  47.37 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  51.28 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3682  PilT domain-containing protein  48.72 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  48.72 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  46.15 
 
 		 134 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>