11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1554 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1554  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1586  hypothetical protein  80.3 
 
 
201 aa  275  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0420  hypothetical protein  80.81 
 
 
201 aa  259  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.453888  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0395  hypothetical protein  80.81 
 
 
201 aa  259  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1542  hypothetical protein  58.85 
 
 
203 aa  229  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1659  hypothetical protein  59.3 
 
 
211 aa  217  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1646  hypothetical protein  59.43 
 
 
205 aa  201  7e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0089  hypothetical protein  47.92 
 
 
207 aa  177  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.104299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1470  hypothetical protein  34.83 
 
 
201 aa  87  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6050  hypothetical protein  28.95 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3046  hypothetical protein  26.7 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.945858  normal  0.137366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>