More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1447 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1447  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0524364  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1566  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
236 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1752  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
236 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1932  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
236 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2119  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  46.22 
 
 
226 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000748349  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.75 
 
 
353 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3849  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.29 
 
 
339 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  26.56 
 
 
631 aa  141  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  29.84 
 
 
548 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2540  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  27.91 
 
 
337 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00259006  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5119  putative ABC transporter ATP-binding  29.02 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  0.157884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  28.29 
 
 
594 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  30.56 
 
 
522 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 
359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.64 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5012  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.92 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.38 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  27.38 
 
 
571 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  25.38 
 
 
588 aa  138  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.63 
 
 
577 aa  138  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  28.29 
 
 
550 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  29.55 
 
 
588 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  27.71 
 
 
548 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  30.71 
 
 
619 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.84 
 
 
329 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
371 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 
331 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.52 
 
 
322 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0222  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.56 
 
 
326 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  26.69 
 
 
543 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  31.05 
 
 
322 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  26.69 
 
 
543 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  26.69 
 
 
543 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  27.67 
 
 
613 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.43 
 
 
353 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.25 
 
 
610 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 
527 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2959  ABC transporter related  30.04 
 
 
599 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0221  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  27.38 
 
 
552 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3627  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.17 
 
 
324 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0234  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  27.82 
 
 
532 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  30.12 
 
 
527 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0269  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  31.22 
 
 
553 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0244  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2766  ABC transporter related  26.51 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0248  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5077  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0826  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.68 
 
 
325 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0205717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0251  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  28.4 
 
 
611 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  27.69 
 
 
552 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0203  hypothetical protein  30.83 
 
 
334 aa  133  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  29.34 
 
 
524 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0129  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  27.13 
 
 
334 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  24.9 
 
 
590 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0212  hypothetical protein  30.83 
 
 
334 aa  133  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  28.63 
 
 
537 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4052  ABC transporter related  28.06 
 
 
612 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0831351  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  28.79 
 
 
562 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  29.23 
 
 
530 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  28.52 
 
 
563 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.04 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0849  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.27 
 
 
346 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4695  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.59 
 
 
325 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5775  ABC transporter related protein  25.49 
 
 
257 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  0.641423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  27.78 
 
 
561 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0211  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.16 
 
 
326 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3651  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.27 
 
 
349 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
536 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2384  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.8 
 
 
346 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  26.48 
 
 
608 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  31.13 
 
 
602 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
536 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  25.81 
 
 
536 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  29.61 
 
 
531 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5708  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.48 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  28.41 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3924  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25.68 
 
 
329 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3504  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  26.98 
 
 
339 aa  131  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.307632  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0473.1  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.909105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  26.46 
 
 
540 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  28.14 
 
 
543 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  27.49 
 
 
557 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7020  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  27.24 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3251  ABC transporter-related protein  28.35 
 
 
570 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.46 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3372  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.78 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  26.21 
 
 
536 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  27.38 
 
 
542 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0384  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  27.1 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2491  ABC transporter related  31.25 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6445  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  26.95 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134411  normal  0.258493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  29.12 
 
 
540 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>