More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1290 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0886  glutamate dehydrogenase  68 
 
 		 452 aa  642    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1815  glutamate dehydrogenase  70.67 
 
 		 452 aa  667    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1290  glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 455 aa  946    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1557  glutamate dehydrogenase  70.89 
 
 		 454 aa  667    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0345  glutamate dehydrogenase  66.89 
 
 		 453 aa  624  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2189  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  64.08 
 
 		 451 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  62.58 
 
 		 450 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  61.37 
 
 		 448 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  60.13 
 
 		 443 aa  569  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1152  glutamate dehydrogenase  61.52 
 
 		 449 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  61.15 
 
 		 448 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  59.96 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  59.04 
 
 		 451 aa  551  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  59.6 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  59.02 
 
 		 450 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  60.44 
 
 		 450 aa  544  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  57.24 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  58.35 
 
 		 450 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  56.6 
 
 		 443 aa  532  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  58.13 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  56.11 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  59.46 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  57.17 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  56.57 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  56.73 
 
 		 445 aa  518  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  54.87 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  58 
 
 		 445 aa  518  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  54.63 
 
 		 448 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  57.21 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  56.76 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  57.14 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  55.04 
 
 		 448 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  56.46 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  55.04 
 
 		 448 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  55.04 
 
 		 448 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  56.29 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  55.9 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  54 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  56.51 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  53.56 
 
 		 451 aa  500  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  56.51 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3000  glutamate dehydrogenase  54.82 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741284  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  56.29 
 
 		 449 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  55.99 
 
 		 450 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  54.15 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  55.85 
 
 		 449 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  54.37 
 
 		 446 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  54.41 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  55.1 
 
 		 451 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  55.51 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  54.17 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  54.34 
 
 		 450 aa  490  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  56.73 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  55.83 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  53.51 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  53.42 
 
 		 445 aa  484  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4667  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  55.26 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  53.93 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  54.28 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  53.01 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  55.94 
 
 		 445 aa  481  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0864  glutamate dehydrogenase  53.51 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.342064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  52.97 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  51.98 
 
 		 450 aa  483  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2123  glutamate dehydrogenase  55.41 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.94 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  52.97 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32600  glutamate dehydrogenase  54.08 
 
 		 447 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3872  glutamate dehydrogenase  55.94 
 
 		 453 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0060  glutamate dehydrogenase  52.98 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.742683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2044  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  54.57 
 
 		 456 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  52.88 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1219  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  53.63 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128767  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2782  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  54.29 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000238369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  52.65 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  52.76 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0996  glutamate dehydrogenase  55.66 
 
 		 451 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0302  glutamate dehydrogenase  54.53 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  53.33 
 
 		 447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  51.97 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4483  glutamate dehydrogenase  53.02 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1339  glutamate dehydrogenase  54.53 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.852226  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5321  glutamate dehydrogenase  52.52 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16151  glutamate dehydrogenase  53.22 
 
 		 451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  53.76 
 
 		 447 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4692  glutamate dehydrogenase  53.74 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1685  glutamate dehydrogenase  53.91 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5524  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  51.76 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148438  normal  0.115697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1212  glutamate dehydrogenase  53.88 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  52.36 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  51.97 
 
 		 447 aa  461  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  51.75 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14650  glutamate dehydrogenase  50.87 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.287682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  52.09 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1457  glutamate dehydrogenase  51.09 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  52.54 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1881  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  53.24 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.53168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2047  glutamate dehydrogenase  53.24 
 
 		 447 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2014  glutamate dehydrogenase  53.24 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1871  glutamate dehydrogenase  53.24 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.598381  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>