201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1222 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1222  thiol peroxidase  100 
 
 
172 aa  353  6.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000685073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1232  thiol peroxidase  53.7 
 
 
175 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0870  thiol peroxidase  53.09 
 
 
175 aa  183  8e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0445504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0800  thiol peroxidase  53.09 
 
 
175 aa  183  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.341037  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0783  thiol peroxidase  51.2 
 
 
174 aa  180  8.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  46.91 
 
 
181 aa  150  8.999999999999999e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  46.71 
 
 
170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  42.77 
 
 
172 aa  137  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  45.39 
 
 
168 aa  135  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0323  thiol peroxidase (scavengase P20)  41.33 
 
 
174 aa  136  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000438204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  42.76 
 
 
179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  42.77 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  37.91 
 
 
167 aa  122  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  43.31 
 
 
171 aa  121  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  40.51 
 
 
167 aa  121  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.51 
 
 
166 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  42.11 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.55 
 
 
228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  38.61 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  36.88 
 
 
169 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  39.38 
 
 
166 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  39.74 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  41.4 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  39.24 
 
 
165 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  39.62 
 
 
167 aa  111  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  41.18 
 
 
167 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.51 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.85 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  41.51 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  39.24 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  42.11 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  39.24 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  40.52 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  40.52 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  37.5 
 
 
166 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.24 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.1 
 
 
171 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  38.99 
 
 
167 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  38.99 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  38.99 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  38.99 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  38.99 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  38.99 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  38.99 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  38.41 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  41.14 
 
 
164 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  41.14 
 
 
164 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  37.82 
 
 
166 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.67 
 
 
163 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  38.41 
 
 
166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  37.74 
 
 
167 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  39.24 
 
 
167 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  36.54 
 
 
232 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.99 
 
 
165 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  39.49 
 
 
171 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  38.61 
 
 
166 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  39.24 
 
 
167 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  37.97 
 
 
166 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  43.59 
 
 
173 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  37.34 
 
 
166 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  38.1 
 
 
164 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.74 
 
 
171 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  38.12 
 
 
173 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  40.13 
 
 
166 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  36.88 
 
 
166 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  38.46 
 
 
171 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  36.88 
 
 
187 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  37.82 
 
 
165 aa  104  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  35.33 
 
 
164 aa  103  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  40.88 
 
 
165 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  39.1 
 
 
171 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  37.34 
 
 
199 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  39.87 
 
 
167 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.75 
 
 
166 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  39.87 
 
 
167 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.56 
 
 
167 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  39.87 
 
 
167 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.97 
 
 
191 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  37.09 
 
 
166 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  40.13 
 
 
166 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.44 
 
 
166 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  40.13 
 
 
166 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  35.85 
 
 
167 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  37.04 
 
 
171 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  37.75 
 
 
167 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  37.75 
 
 
167 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  35.85 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  37.97 
 
 
168 aa  99  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  36.48 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  36.42 
 
 
165 aa  98.6  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  35.22 
 
 
166 aa  98.2  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3537  thiol peroxidase  33.96 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.515371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>